群れの中から女王蜂を迅速かつ確実に識別するために、女王蜂の背中にマーキングを行います。また、マーキングは西暦の下一桁目の数値によって色を変更する国際的な取り決めがあり、マーキングした色から女王蜂の年齢を確認できます。
マーキングには、市販されている不透明油性速乾性マーカーを使用します。まず、女王蜂を掴みます。潰さないように優しく掴み、背中にマーキングを行います。この作業は、ある程度の経験が必要だと思います。また、マーカーを塗りすぎないようにしなければなりません。匂いが残っていると、警戒蜂が女王蜂に対して攻撃的になることがあるそうです。

